真核轉(zhuǎn)錄組測序

主要針對轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物mRNA進行高通量測序，可快速獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的基因表達量及結(jié)構(gòu)變異等，可用于差異表達分析、挖掘功能基因、RNA編輯分析等。目前已廣泛應(yīng)用于生物學(xué)研究、農(nóng)業(yè)、醫(yī)學(xué)等多個領(lǐng)域，揭示生物生長發(fā)育調(diào)控機制、不同環(huán)境適應(yīng)機制、作物優(yōu)良形成機理、疾病發(fā)生發(fā)展的分子機理等。

應(yīng)用領(lǐng)域：

樣本全轉(zhuǎn)錄本信息獲取

基因注釋及篩選

基因結(jié)構(gòu)分析

產(chǎn)品優(yōu)勢：

準確的數(shù)字化信號，專業(yè)的檢測通量，廣泛的檢測范圍

富涵7大功能注釋數(shù)據(jù)庫，準確描述基因功能

建立差異表達分析，有效挖掘功能基因

專業(yè)的定制化信息分析服務(wù)

標準信息分析

1.測序數(shù)據(jù)及其質(zhì)量控制

2.轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)組裝

3.轉(zhuǎn)錄組文庫質(zhì)量評估

4. Unigene功能注釋

5.基因結(jié)構(gòu)分析：CDS預(yù)測、SSR分析、SNP分析

6.基因表達量分析：Unigene表達量計算、不同樣品總體表達量比對

7.差異表達分析： 重復(fù)相關(guān)性評估、差異表達基因篩選、差異表達基因聚類分析

8.差異表達基因功能注釋和富集分析：差異表達基因GO功能富集、差異表達基因COG分類、差異表達基因KEGG注釋、差異表達基因KEGG通路富集分析

樣品要求：

1.樣品類型：總RNA；

2.樣品濃度：≥250 ng/ul；

3.樣品總量：>6ug(真核生物)；>10ug（原核生物）

4.樣品純度： OD260/280為1.8~2.2，OD260/230≥1.0，260nm處有正常峰值。

5.RNA完整性： 電泳檢測28S/18S≥1.5。（距送樣日最近的電泳結(jié)果）